Осенью 2003 года мир столкнулся с невиданной ранее угрозой. Кордицепс, ранее поражавший лишь насекомых, мутировал и начал заражать людей. Грибок захватывал сознание жертв, превращая их в нечто ужасное. В тот роковой день обычный рабочий Джоэл потерял самое дорогое, оказавшись в самом центре катастрофы.
Прошло два десятилетия. Теперь Джоэл выживает в закрытой зоне Бостона, где правит военное ведомство, отвечающее за кризисные ситуации. Вместе с подругой Тэсс он ищет способ выбраться из города, чтобы разыскать родного брата. Им срочно нужен аккумулятор для машины.
Внезапно их пути пересекаются с раненой женщиной — предводительницей сопротивления. Она предлагает сделку: если Джоэл и Тэсс проводят через опасные территории юную Элли, им достанется и транспорт, и нужная запчасть. Девочке всего четырнадцать, она упряма и не привыкла слушаться, но её ждёт отряд повстанцев за пределами карантина.